O Centro de Saúde Pública de Precisão (CSPP) da Fiocruz Paraná, em conjunto com o Instituto de Tecnologia do Paraná (Tecpar) e o Instituto de Biologia Molecular do Paraná (IBMP), seleciona bolsista de pós-doutorado em Bioinformática no Novo Arranjo em Pesquisa e Inovação (NAPI) Saúde Pública de Precisão.
O profissional selecionado atuará na estruturação e análise de dados genômicos em larga escala, oferecendo o suporte bioinformático essencial para a pesquisa de ponta em saúde de precisão no Paraná.
Qualificação:
Doutorado em áreas como Bioinformática, Biologia Computacional, Genética, Informática Biomédica, ou afins, com experiência comprovada na interface entre genética humana e computação.
Atribuições:
- Desenvolver, implementar e otimizar pipelines para o processamento de dados de Sequenciamento de Genoma Completo (WGS), incluindo alinhamento, controle de qualidade, e chamada de diferentes tipos de variantes (SNVs, Indels, CNVs, SVs).
- Gerenciar e manter a integridade dos dados genômicos e dos bancos de dados de variantes gerados pelo projeto.
- Criar e manter scripts para a automação de análises recorrentes, visando a escalabilidade e reprodutibilidade dos resultados.
- Oferecer suporte bioinformático para as equipes de bancada molhada e de analistas, auxiliando na resolução de desafios técnicos e na compreensão de artefatos e vieses inerentes ao processamento dos dados genômicos.
- Pesquisar, avaliar e implementar novas ferramentas, algoritmos e abordagens computacionais para aprimorar o fluxo de análise de dados genômicos.
- Colaborar no desenho de estratégias para análises secundárias e na exploração dos dados genômicos gerados.
- Auxiliar na elaboração de relatórios técnicos e na preparação de dados para publicação científica.
Pré-requisitos:
- Proficiência em ambiente de linha de comando (Linux/Unix).
- Domínio de linguagens de programação para análise de dados e automação, como Bash, Python e/ou R.
- Familiaridade com o processamento de dados de WGS, incluindo manipulação de formatos de arquivo padrão (FASTQ, BAM/CRAM, VCF).
- Familiaridade com pipelines de análise de variantes, utilizando ferramentas padrão para alinhamento (ex: BWA), manipulação de dados (ex: Samtools, Picard) e genotipagem (ex: GATK HaplotypeCaller).
- Conhecimento de estratégias e ferramentas para anotação funcional de variantes genéticas (ex: VEP, SnpEff, Annovar).
- Conhecimento de sistemas de controle de versão (Git/GitHub).
- Inglês técnico para leitura e escrita.
Desejáveis:
- Experiência com conteinerização de software (Docker).
- Familiaridade com a plataforma Illumina DRAGEN Bio-IT.
Modalidade: Presencial
Local de trabalho: Centro de Saúde Pública de Precisão (CSPP) no campus do Tecpar (Curitiba/PR).
Valor da Bolsa: R$5.125,00
Duração: 12 meses, com possibilidade de prorrogação
Benefício: Transporte fretado
Seleção: Análise de currículo, carta de apresentação e entrevista.
Interessados: Enviar currículo e carta de recomendação para napispp.icc@fiocruz.br até 31 de outubro de 2025. O e-mail deve conter obrigatoriamente o assunto: “Vaga Pós-Doc Bioinformática NAPI SPP”.