PCR em Tempo Real (qPCR) é uma tecnologia amplamente testada e aprovada no mercado de testes diagnósticos para detecção específica de alvos moleculares de importância clínica (DNA ou RNA), devido à sua grande versatilidade e maior eficiência em relação aos tradicionais ensaios imunoenzimáticos (ELISA). Por estar disponível há muitos anos, existem hoje diferentes versões de kits comerciais com variações nas formulações e nos equipamentos usados para detecção das moléculas alvo, o que dificulta sua implementação no sistema público de saúde brasileiro. Por outro lado, é comum não existir infraestrutura suficiente para a instalação e manutenção de equipamentos tradicionais de qPCR, além de existirem poucos profissionais capacitados para operá-los. Nesse sentido, equipamentos portáteis de diagnóstico de base molecular podem ser de grande auxílio para o manejo de doenças negligenciadas em situações de baixa densidade tecnológica, como as encontradas nos pontos de atendimento (“point of care”).

Assim, esta linha de pesquisa tem por objetivo desenvolver novos testes diagnósticos para uso em plataformas comuns em laboratórios de diagnóstico (Laboratórios Centrais, Laboratórios de Referência, por exemplo) ou plataformas portáteis baseadas na tecnologia PCR Tempo Real, usando reagentes produzidos no Brasil pelo Instituto de Biologia Molecular do Paraná (IBMP), para atender as demandas do Sistema Único de Saúde (SUS) em relação ao diagnóstico de doenças de interesse nacional, como por exemplo doença de chagas, malária, tracoma, tuberculose, hanseníase, zika, dengue, chikungunya, febre amarela, coqueluche, dentre outras.

Pesquisador Responsável: Dr. Alexandre D. T. Costa

– Pesquisa e desenvolvimento de novas soluções para auxílio no diagnóstico de doenças negligenciadas e/ou tropicais, tais como malária, tuberculose, hanseníase, leishmaniose, entre outras.

– Desenvolvimento e avaliação de biossensores eletroquímicos para auxílio no diagnóstico de doenças do Plano Nacional de Triagem Neonatal (Teste do Pezinho) diretamente no ponto de atendimento.

– Avaliação de técnicas moleculares para detecção de patógenos de interesse sanitário nacional em animais silvestres.

– Avaliação de autotestagem como ferramenta para monitoramento em grande escala da covid19

– Construção e avaliação de um dispositivo portátil integrado com nanomateriais semicondutores para auxílio no diagnóstico de fibrose cística

Pesquisador Responsável: Dr Fabricio Klerynton Marchini

• – Desenvolvimento de Kits moleculares para diagnóstico in-vitro (HPV; Virus respiratórios; Tb MDR; Leishmania; Malária)- Desenvolvimento de Kits imunológicos para diagnóstico in-vitro (Tipagem sanguínea; Infarto agudo miocárdio; Dengue NS1; Chikungunya Antigênico)

  – Desenvolvimento de Equipamentos para diagnóstico in-vitro (Leitor de teste rápido; Lab-on-a-Chip)

  – Desenvolvimento de Proteínas terapêuticas para saúde humana (Alfa-trombina; ADC tratamento de câncer; PDC para tratamento de doença auto-imune)

https://www.icc.fiocruz.br/lactas/biomarcadores-e-testes-diagnosticos-para-doencas-infectocontagiosas-e-cronicas-nao-transmissiveis/

A linha de pesquisa em Engenharia de equipamentos e sistemas biomédicos é essencialmente multidisciplinar, englobando profissionais de diversas áreas como: engenharia eletrônica, mecânica e biomédica, física, software, química e biologia. Por esse motivo, estudantes de diversas áreas do conhecimento podem desenvolver projetos de mestrado e doutorado em nosso laboratório. Nosso foco é o desenvolvimento de sistemas biomédicos para diagnóstico rápido de doenças. Nossos projetos englobam: construção de softwares, sistemas eletrônicos, aplicativos, programação de sistemas microcontrolados, desenhos técnicos de chips microfluídicos, construção de dispositivos Lab-on-a-Chip, impressão 3D, desenvolvimento de sensores, entre outros. Nós trabalhamos com ciência aplicada,  transformando conhecimento em tecnologia a ser disponibilizada à população.  

Pesquisador Responsável: Dr. Lucas Blanes

• PCR em chip – Desenvolvimento de equipamento para teste de DNA (PCR) em chip para detecção de Leishmaniose.
• Leitora Multiteste – Desenvolvimento de protótipo Industrial  de leitora automatizada de diagnósticos do tipo lateral-flow.

O diagnóstico de MPN e a determinação do agente etiológico envolve avaliação clínica e exames laboratoriais, sendo as análises realizadas no líquido cefalorraquidiano (LCR) essenciais para o diagnóstico. As alterações no LCR após neurocirurgias podem assemelhar-se às alterações encontradas em MPN, tanto bacteriana, quanto asséptica, tornando o diagnóstico um verdadeiro desafio. Este projeto visa contribuir para o entendimento das MPNs, identificando por LC-MS/MS as proteínas presentes no LCR de pacientes apresentando diferentes tipos de MPN (bacteriana e asséptica). Além disso, a proposta visa um estudo prospectivo acerca do uso de LC-MS/MS na identificação das espécies bacterianas causadoras de MPN. Estes estudos têm o potencial de identificar biomarcadores que possibilitem a classificação das MPNs em tempo menor que as análises disponíveis, por exemplo, baseadas no cultivo microbiológico auxiliando no manejo mais adequado dos pacientes, como por exemplo, no uso racional de antibióticos.

Pesquisador Responsável: Dr. Michel Batista

• Avaliação do perfil proteico do líquido cefalorraquidiano de pacientes com meningite hospitalar buscando biomarcadores diagnósticos.

Pesquisador Responsável: Dr. Luis Gustavo Morello 

• Busca de biomarcadores associados ao diagnóstico e prognóstico em sepse.

Os antibióticos revolucionaram a medicina nas décadas de 1930 e 1940, salvando milhões de vidas. No entanto, seu uso indiscriminado levou rapidamente ao surgimento das primeiras cepas de bactérias resistentes à penicilina em 1950 e, nos 40 anos subsequentes, ao surgimento de bactérias resistentes a todos os antibióticos disponíveis, tornando-se um problema mundial. De modo geral, a resistência bacteriana surge quando uma alteração no genoma, que pode resultar de uma mutação espontânea e/ou aquisição gênica, provoca alterações bioquímicas que modificam a concentração intracelular ou a afinidade do alvo pelo antimicrobiano. Essas mudanças no genoma criam a variabilidade genética sobre a qual a seleção natural atua, dando vantagens aos organismos mais aptos. Os medicamentos atuam como agentes seletivos, favorecendo as raras bactérias resistentes presentes na população. O sequenciamento de DNA de nova (ou segunda) geração iniciou uma grande revolução na área da genômica e transcritômica de microrganismos. Na área de estudo da resistência a antimicrobianos a genômica se tornou uma ferramenta fundamental para descoberta de fatores de resistência, seja pela simples mudança de um nucleotídeo em um gene (SNP) ou mesmo aquisições de grandes ilhas genômicas e plasmídeos. Nosso grupo tem como objetivo a investigação dos mecanismos de resistência aos antimicrobianos, incluindo seu surgimento, evolução e disseminação, através de metodologias ômicas e ferramentas de bioinformática.

• Investigação dos mecanismos de resistência a múltiplos antibióticos em Klebsiella pneumoniae pan-resistente utilizando abordagem multi-omics 

• Caracterização morfológica e molecular de vesículas extracelulares oriundas de bactérias resistentes a antibióticos do grupo ESKAPE 

•  Estudo de fatores genéticos relacionados ao desenvolvimento de sepse: correlação entre severidade, patógeno e proteínas do sangue 

Pesquisador Responsável

•  Helisson Faoro

Foram somadas duas outras características na década seguinte: reprogramação do metabolismo energético e resposta imune evasiva. Também foram adicionadas duas características facilitadoras, instabilidade genômica e inflamação. A difícil tarefa de compreender o câncer levou a essas tentativas de simplificação da doença, mas à medida que as novas descobertas científicas adicionam novas camadas de complexidade ao que conhecemos sobre o câncer, há constante necessidade de renovação e revisão destas características.

A compreensão das moléculas que participam das alterações associadas ao desenvolvimento do câncer constitui a base para a descoberta de biomarcadores que podem ser usados para detecção mais precoce do câncer e para a identificação de possíveis alvos em busca de terapias mais específicas e eficazes. O estudo das moléculas e das vias de sinalização das células tumorais é útil para a predição e acompanhamento da resposta clínica e para prever a possibilidade de recorrência de tumores. Além disso, inquéritos de epidemiologia molecular também são importantes ferramenta em pesquisas na área de Câncer.

A equipe de Biologia Molecular do Câncer conduz projetos de pesquisa básica e translacional com potencial para gerar testes de diagnóstico e de acompanhamento de tratamento que tenham aplicação prática na Oncologia Clínica.

Pesquisador Responsável: Dr. Mateus Aoki

• Estudo de alterações genéticas e microRNA plasmáticos em pacientes com câncer de pâncreas no Brasil.
• Análise de lócus de susceptibilidade ao câncer de pâncreas no âmbito de DNA germinativo e somático.
• Análise das Principais Translocações de Impacto Clínico em Leucemias e Buscas de Novos biomarcadores.
• Desenvolvimento de testes moleculares para detecção e quantificação de translocações em pacientes com leucemia.

Pesquisadora Responsável: Dra. Dalila L. Zanette

• Hematopoese Clonal e inflamação em pacientes com tumores primários de próstata;
• Marcadores de acompanhamento da terapia com inibidores de tirosina quinase em leucemia mieloide crônica.
• Marcadores de acompanhamento da terapia com inibidores de tirosina quinase em leucemia mieloide crônica.