O Trypanosoma cruzi apresenta um ciclo complexo na natureza envolvendo pelo menos três estágios distintos de desenvolvimento e dois hospedeiros intermediários. A alternância de tipos funcionalmente e morfologicamente distintos implica que genes distintos são expressos pelos vários estágios de diferenciação durante o ciclo de vida do parasita. Os mecanismos envolvidos na regulação da expressão gênica em tripanosomatídeos ainda permanecem desconhecidos em sua grande extensão. Promotores para RNA polimerase II ainda não foram funcionalmente caracterizados em tripanosomatídeos e o fato da transcrição de mRNAs ser essencialmente policistrônica, com o posterior processamento dos transcritos primários por “trans-splicing”, sendo que mRNAs que são co-transcritos apresentam diferentes níveis de expressão no citoplasma, indica que a regulação da expressão gênica ocorre principalmente (se não exclusivamente) por mecanismos pós-transcricionais). O estudo dos complexos ribonucleoproteicos mensageiros e das proteínas que interagem com o mRNA poderá evidenciar novos mecanismos de modulação da expressão gênica em parasitas baseados na alteração da estabilidade dos mRNAs e permitir um maior conhecimento sobre a modulação do decaimento estágio-especifico dos mRNAs ou a acessibilidade dos mRNAs à maquinaria traducional. Os objetivos específicos visam o estudo de biologia de sistemas aplicado a redes de regulação pós-transcricionais através do estudo de complexos mRNP e seu papel na modulação da expressão gênica do T. cruzi.