A produção e análise de dados de sequenciamento de DNA em larga escala e de espectrometria de massas podem ser usados para estudar a diversidade dos genomas, transcriptomas e proteomas humano e murino utilizando abordagens de bioinformática. Desta forma, são analisados aspectos da diversidade da genética humana, de transcritos e suas proteínas no contexto de enfermidades de importância de saúde pública. Como exemplo de pesquisas que o nosso grupo está participando, podem ser citados: 1) sequenciamento do genoma completo de amostras de pacientes do SUS de coortes de interesse do Ministério da Saúde por meio da participação na rede Genomas SUS; 2) o papel da diversidade genética humana nos diferentes desfechos clínicos de pacientes com COVID-19; 3) desenvolvimento de algoritmos para a identificação de proteínas oriundas de eventos de splicing alternativo ortólogas entre diferentes espécies e a sua relação com doenças do sistema nervoso central e tumores humanos; e 4) desenvolvimento de abordagens computacionais para o estudo de patógenos humanos como, por exemplo, fungos e vírus.
Bioinformática e Genoma humano
The production and analysis of large-scale DNA sequencing and mass spectrometry data can be used to study the diversity of human and murine genomes, transcriptomes, and proteomes using bioinformatics approaches. Aspects of the diversity of human genetics, transcripts, and its proteins are analyzed in the context of human diseases and public health. Currently, our group is contributing in some studies in the following areas: 1) whole-genome sequencing of SUS patient samples from cohorts of interest to the Ministry of Health through participation in the Genomas SUS network; 2) the role of human genetic diversity in the different clinical outcomes of patients with COVID-19; 3) development of algorithms for the identification of proteins originating from orthologous alternative splicing events between different species and their relationship with diseases of the central nervous system and human tumors; and 4) development of computational approaches for the study of human pathogens, such as fungi and viruses.